Unit Hal Ehwal Akademik MRSM Kubang Pasu bertanggungjawab dalam mengawalselia perjalanan sistem pengajaran dan pembelajaran guru-guru di MRSM. Unit ini memainkan peranan penting dalam menyusun program-program pendidikan untuk mempertingkatkan pencapaian akademik pelajar maktab. Selain itu unit ini juga bertanggungjawab dalam memastikan kemudahan-kemudahan pembelajaran di MRSM sentiasa terkawal dan mencukupi seperti kemudahan komputer (Internet), buku rujukan dan lain-lain.

Unit dan jawatankuasa dibawah seliaan Unit Hal Ehwal Akademik antaranya :

  • Jabatan Matematik
  • Jabatan Sains
  • Jabatan Sains Sosial
  • Jabatan Bahasa
  • Unit Peperiksaan & Penilaian Maktab
  • Unit Teknologi Maklumat
  • Jawatankuasa Senat Maktab
  • Jawatankuasa Induk IGCSE
  • Jawatankuasa English Every Day Programme (EEDP)
  • Jawatankuasa Induk PBS
  • Jawatankuasa Program IGCSE & PBS Tingkatan 1
  • Jawatankuasa Program IGCSE & PBS Tingkatan 2
  • Jawatankuasa Program 3G PBSMR
  • Jawatankuasa Program 3G Tingkatan 4
  • Jawatankuasa Program 3G SPM
  • Jawatankuasa Pusat Sumber Pembelajaran Buku Teks
  • Jawatankuasa 'The Schoolwide Enrichment Model'
  • Jawatankuasa ICT Maktab
  • Jawatankuasa Penandaarasan Maktab (EDEX)
  • Jawatankuasa Standard Pendidikan MARA (SPMa)
  • Jawatankuasa Pengurusan Bilik Darjah
  • Jawatankuasa Mentoring
  • Jawatankuasa Peningkatan Profesinalisma Guru & Staf
  • Jawatankuasa International Competitions And Assessments for School (ICAS)
  • Jawatankuasa Program Pengayaan (KKB & KAB)
  • Jawatankuasa Berkala Hal Ehwal Akademik